Szemantikus web technológiák felhasználása orvos-biológiai tudás kinyerésére

Tanszéki konzulens: 
A munkatárs fényképe
docens
Szoba: E423
Tel.:
+36 1 463-4394
Email: antal (*) mit * bme * hu
Külső konzulens: 
Gézsi András

A kiírás adatai

A téma státusza: 
Aktív (aktuális, lehet rá jelentkezni)
Kiírás éve: 
2016
A kiírás jellege: 
önálló labor

Az ún. Resource Description Framework (RDF) W3C ajánlás megjelenése óta az RDF formátumú, publikusan elérhető adatok mennyisége rendkívül gyorsan növekszik. Az orvosbiológiai tudás egy jelentős része szintén elérhető RDF adatbázisok formájában. Az OpenPHACTS projekt számos ilyen adatbázist integrált, amely által elérhetővé vált többek között a gyógyszermolekulák, a gyógyszercélpontok, a génszabályozási útvonalak, a szövetek, a betegségek és a gének funkcionális leírásai közötti kapcsolatok lekérdezése. Ez lehetővé teszi az adatokban lévő összefüggések részletes feltérképezését és új biológiai, orvosi következtetések levonását, illetve a gyógyszerek fejlesztésének támogatását. Az adatok rendkívül nagy mennyisége azonban számos kihívást támaszt az adatokat felhasználni kívánó kutatókkal szemben. Az adatbázisok „struktúrájának” feltérképezése, az egymással kapcsolódó entitások megismerése, a lehetséges következtetések típusainak meghatározása és az lekérdezések optimalizálása önmagában is nehéz feladat.

A hallgató feladatai az önálló labor során az alábbi részfeladatokat foglalják magukban:

  • A szemantikus web technológiák megismerése.
  • A tanszéki Virtuoso rendszer megismerése; orvosbiológiai adatbázisok betöltése, lekérdezése.
  • Az adatbázis lekérdezéseinek felgyorsítása optimális lekérdezési heurisztikák megismerésével és használatával.
  • További orvosbiológiai tudásbázisok „RDF-esítése”; a feladat megoldására egy általánosan használható keretrendszer kifejlesztése.

A téma szakdolgozat illetve diplomaterv készítésére is alkalmas.

© 2010-2019 BME MIT | Hibajelentés | Használati útmutató