Génszekvenáló műszer digitális kompenzálása

Tanszéki konzulens: 
A munkatárs fényképe
tanszékvezető, egyetemi tanár
Szoba: IE442
Tel.:
+36 1 463-2065
Email: daboczi (*) mit * bme * hu

A kiírás adatai

A téma státusza: 
Korábbi (jelenleg nem aktív, de látszik)
Kiírás éve: 
2013
A kiírás jellege: 
önálló labor, szakdolgozat/diplomaterv

A genetikai kód meghatározására (gén szekvenálás) többféle eljárás, illetve műszer létezik. Ezek közül az egyik az ún. nanopórus, melynek lényege, hogy egy membrán parányi pórusán (nanopórus) áthaladó DNS szál a póruson való áthaladás közben megfigyelehető, azonosítható. Ehhez a membrán két részét megfelelő feszültség alá helyezik, majd mérik az áramot. A DNS szál áthaladásakor ez az áram a genetikai kódnak megfelelő áramugrások formájában jelentkezik. Mivel nagyon kis áramok méréséről van szó, igen nagy a zajszint, ezért analóg aluláteresztő szűrőt alkalmaznak a mintavételezés előtt. Ez a szűrés azonban torzítja a hasznos jelet, így az állapotváltozások ideje nem detektálható kellő pontossággal.

Feladatok:

- mérési környezet módosítása a felbontás javítása érdekében

- inverz szűrési módszerek (jelek digitális utófeldolgozása) adaptálása a szűrő torzításának kompenzálására

Szükséges ismereket:

- digitális jelfeldolgozás

Együttműködő partner:

- University of California, Santa Cruz, USA

A témára MSc hallgatót várok. Angol nyelvtudás szükséges

© 2010-2024 BME MIT | Hibajelentés | Használati útmutató