Tanszéki konzulens: 

Szántó Péter mesteroktató Szoba: IE336 Tel.: +36 1 463-2066 Email: szanto (*) mit * bme * hu

Számos bioniformatikai feladatban felmerül megoldandó problémaként a sejtfelismerés. Erre számos szoftveres megoldás létezik, ilyen például a Matlab alapokon is elérhető, nyílt forráskódú CellProfiler, amely viszonylag sok, szabadon kombinálható képfeldolgozó eljárást foglal magában (pl. szürkeárnylatossá alakítás, binarizálás küszöbszint alapján, éldetektálás, ...). Az önálló laboratórium célja a CellProfiler eljárás-készletének megismerése, és az algoritmusok felgyorsítása GPU (Graphics Processing Unit) segítségével. A GPU programozása történhet NVIDIA Cuda vagy OpenCL nyelvek használatával.