Tanszéki konzulens: 

Antal Péter associate professor Szoba: E435 Tel.: +36 1 463-2677 Email: antal (*) mit * bme * hu

Az ún. Resource Description Framework (RDF) W3C ajánlás megjelenése óta az RDF formátumú, publikusan elérhető adatok mennyisége rendkívül gyorsan növekszik. Az orvosbiológiai tudás egy jelentős része szintén elérhető RDF adatbázisok formájában. Az OpenPHACTS projekt számos ilyen adatbázist integrált, amely által elérhetővé vált többek között a gyógyszermolekulák, a gyógyszercélpontok, a génszabályozási útvonalak, a szövetek, a betegségek és a gének funkcionális leírásai közötti kapcsolatok lekérdezése. Ez lehetővé teszi az adatokban lévő összefüggések részletes feltérképezését és új biológiai, orvosi következtetések levonását, illetve a gyógyszerek fejlesztésének támogatását. Az adatok rendkívül nagy mennyisége azonban számos kihívást támaszt az adatokat felhasználni kívánó kutatókkal szemben. Az adatbázisok „struktúrájának” feltérképezése, az egymással kapcsolódó entitások megismerése, a lehetséges következtetések típusainak meghatározása és az lekérdezések optimalizálása önmagában is nehéz feladat.

A hallgató feladatai az önálló labor során az alábbi részfeladatokat foglalják magukban:

• A szemantikus web technológiák megismerése.
• A tanszéki Virtuoso rendszer megismerése; orvosbiológiai adatbázisok betöltése, lekérdezése.
• Az adatbázis lekérdezéseinek felgyorsítása optimális lekérdezési heurisztikák megismerésével és használatával.
• További orvosbiológiai tudásbázisok „RDF-esítése”; a feladat megoldására egy általánosan használható keretrendszer kifejlesztése.

A téma szakdolgozat illetve diplomaterv készítésére is alkalmas.